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2003
2002
GTPCH I と GFRP との高活性型複合体の結晶構造
哺乳動物において、 GTPからBH4を新生する一連の生合成経路の律速初発反応の酵素GTP cyclohydrolase I (GTPCHI)とそのフィードバック制御蛋白質GFRPとのフェニルアラニン誘導活性促進型複合体の結晶構造を決定して，活性促進の機構を明らかにした。
Maita N. et al., and Hakoshima T.
Crystal structure of the stimulatory complex of GTP cyclohydrolase I and its feedback regulatory protein GFRP.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Feb 5;99(3):1212-7.
[ Journal / PubMed / PDB(1IS7,1IS8) ]
哺乳動物において、 GTPからBH4を新生する一連の生合成経路の律速初発反応の酵素GTP cyclohydrolase I (GTPCHI)とそのフィードバック制御蛋白質GFRPとのフェニルアラニン誘導活性促進型複合体の結晶構造を決定して，活性促進の機構を明らかにした。
Maita N. et al., and Hakoshima T.
Crystal structure of the stimulatory complex of GTP cyclohydrolase I and its feedback regulatory protein GFRP.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Feb 5;99(3):1212-7.
[ Journal / PubMed / PDB(1IS7,1IS8) ]
Merlinの FERM ドメインの結晶構造
ヒト神経線維芽腫瘍II型遺伝子NF2のコードする蛋白質merlinの膜結合領域（FERM様ドメイン）の結晶構造を決定して，これがradixinなどのERM蛋白質のドメインと基本的に同一であることを示すとともに，患者遺伝子解析から同定された多数の変異がドメインの構造と機能に及ぼす影響を考察した。
Shimizu T. et al., and Hakoshima T.
Structural basis for neurofibromatosis type 2. Crystal structure of the merlin FERM domain.
J Biol Chem. 2002 Mar 22;277(12):10332-6.
[ Journal / PubMed / PDB ]
ヒト神経線維芽腫瘍II型遺伝子NF2のコードする蛋白質merlinの膜結合領域（FERM様ドメイン）の結晶構造を決定して，これがradixinなどのERM蛋白質のドメインと基本的に同一であることを示すとともに，患者遺伝子解析から同定された多数の変異がドメインの構造と機能に及ぼす影響を考察した。
Shimizu T. et al., and Hakoshima T.
Structural basis for neurofibromatosis type 2. Crystal structure of the merlin FERM domain.
J Biol Chem. 2002 Mar 22;277(12):10332-6.
[ Journal / PubMed / PDB ]
2000
Radixin FERM ドメインの結晶構造
細胞膜とアクチン細胞骨格を繋ぐリンカー蛋白質ERMの一つであるradixinの膜結合領域（FERMドメイン）の結晶構造を決定して，このドメインが３つのサブドメインA（ユビキチン様構造），B（Acyl-CoA結合ドメイン様構造），C（PH/PTBドメイン様構造）からなり，サブドメインAとCからなる負に荷電した分子側面で膜と会合することを示した。
Radixin FERM ドメインとIP3 との複合体の結晶構造
細胞膜とアクチン細胞骨格を繋ぐリンカー蛋白質ERMの一つであるradixinの膜結合領域（FERMドメイン）と膜成分PIP2（Phosphatidyl-Inositol-bis-Phosphate）の細胞質部位IP3との複合体結晶構造を決定し，IP3の認識機構やradixinの膜への会合，unmasking機構を三次元構造に基づいて解明した。
Hamada K. et al., and Hakoshima T.
Structural basis of the membrane-targeting and unmasking mechanisms of the radixin FERM domain.
EMBO J. 2000 Sep 1;19(17):4449-62.
[ Journal / PubMed / PDB ]
Mg2+イオン非結合状態のGDP結合型RhoAの結晶構造
Mg2+イオンの結合していないGDP結合型RhoAの結晶構造を決定し，GDP/GTP交換反応におけるスイッチI領域の構造変化においてMg2+イオンが中心的な役割を果たしていることを示した。
Shimizu T. et al., and Hakoshima T.
An open conformation of switch I revealed by the crystal structure of a Mg2+-free form of RHOA complexed with GDP. Implications for the GDP/GTP exchange mechanism.
J Biol Chem. 2000 Jun 16;275(24):18311-7.
[ Journal / PubMed / PDB ]
Mg2+イオンの結合していないGDP結合型RhoAの結晶構造を決定し，GDP/GTP交換反応におけるスイッチI領域の構造変化においてMg2+イオンが中心的な役割を果たしていることを示した。
Shimizu T. et al., and Hakoshima T.
An open conformation of switch I revealed by the crystal structure of a Mg2+-free form of RHOA complexed with GDP. Implications for the GDP/GTP exchange mechanism.
J Biol Chem. 2000 Jun 16;275(24):18311-7.
[ Journal / PubMed / PDB ]
転写因子Pap1とDNAとの複合体の結晶構造
分裂酵母由来のAP-1様のbZIP型転写因子Pap1のDNA結合領域と非共通配列を持つ標的DNA（TTACGTAA）との複合体の結晶構造を決定し，この配列がNXXAQXXFRモチーフで認識されていることを示し，bZIP型転写因子の塩基認識機構の多様性を三次元構造から明らかにした。
Fujii Y. et al., and Hakoshima T.
Structural basis for the diversity of DNA recognition by bZIP transcription factors.
Nat Struct Biol. 2000 Oct;7(10):889-93.
[ Journal / PubMed / PDB ]
分裂酵母由来のAP-1様のbZIP型転写因子Pap1のDNA結合領域と非共通配列を持つ標的DNA（TTACGTAA）との複合体の結晶構造を決定し，この配列がNXXAQXXFRモチーフで認識されていることを示し，bZIP型転写因子の塩基認識機構の多様性を三次元構造から明らかにした。
Fujii Y. et al., and Hakoshima T.
Structural basis for the diversity of DNA recognition by bZIP transcription factors.
Nat Struct Biol. 2000 Oct;7(10):889-93.
[ Journal / PubMed / PDB ]
1999
ArcBのHPtドメインとCheYとの複合体
大腸菌の環境センサー蛋白質ArcBのリン酸基転移領域（HPt）と走化性応答レギュレーター蛋白質CheYとの複合体結晶構造を決定した。
Kato M. et al., and Hakoshima T.
Structure of the histidine-containing phosphotransfer (HPt) domain of the anaerobic sensor protein ArcB complexed with the chemotaxis response regulator CheY.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 1999 Jul;55 ( Pt 7):1257-63.
[ Journal / PubMed / PDB ]
大腸菌の環境センサー蛋白質ArcBのリン酸基転移領域（HPt）と走化性応答レギュレーター蛋白質CheYとの複合体結晶構造を決定した。
Kato M. et al., and Hakoshima T.
Structure of the histidine-containing phosphotransfer (HPt) domain of the anaerobic sensor protein ArcB complexed with the chemotaxis response regulator CheY.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 1999 Jul;55 ( Pt 7):1257-63.
[ Journal / PubMed / PDB ]
RhoAとPKNとの複合体の結晶構造
活性型（GTPγS結合型）低分子量G蛋白質RhoAの標的分子であるセリン・スレオニンキナーゼPKNのRho結合領域との複合体結晶構造を決定し，Rhoの標的分子認識機構を世界に先駆けて解明した。ロイシンジッパー様配列（Type I）を持つPKNのRho結合領域は，α-ヘリックスの逆平行の会合構造を形成している。
Maesaki R. et al., and Hakoshima T.
The structural basis of Rho effector recognition revealed by the crystal structure of human RhoA complexed with the effector domain of PKN/PRK1.
Mol Cell. 1999 Nov;4(5):793-803.
[ Journal / PubMed / PDB ]
活性型（GTPγS結合型）低分子量G蛋白質RhoAの標的分子であるセリン・スレオニンキナーゼPKNのRho結合領域との複合体結晶構造を決定し，Rhoの標的分子認識機構を世界に先駆けて解明した。ロイシンジッパー様配列（Type I）を持つPKNのRho結合領域は，α-ヘリックスの逆平行の会合構造を形成している。
Maesaki R. et al., and Hakoshima T.
The structural basis of Rho effector recognition revealed by the crystal structure of human RhoA complexed with the effector domain of PKN/PRK1.
Mol Cell. 1999 Nov;4(5):793-803.
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転写因子IRF-2とDNAとの複合体の結晶構造
マウスインターフェロン制御因子IRF-2のDNA結合領域（wHTHドメイン）と標的DNAとの複合体結晶構造を決定し，繰り返し配列（AANNGAAA）を持つDNAを，タンデムに結合したIRF-2が認識することを明らかにした。
Fujii Y. et al., and Hakoshima T.
Crystal structure of an IRF-DNA complex reveals novel DNA recognition and cooperative binding to a tandem repeat of core sequences.
EMBO J. 1999 Sep 15;18(18):5028-41.
[ Journal / PubMed / PDB ]
マウスインターフェロン制御因子IRF-2のDNA結合領域（wHTHドメイン）と標的DNAとの複合体結晶構造を決定し，繰り返し配列（AANNGAAA）を持つDNAを，タンデムに結合したIRF-2が認識することを明らかにした。
Fujii Y. et al., and Hakoshima T.
Crystal structure of an IRF-DNA complex reveals novel DNA recognition and cooperative binding to a tandem repeat of core sequences.
EMBO J. 1999 Sep 15;18(18):5028-41.
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2-Cys型ペルオキシレドキシンHBP23の結晶構造
ラット由来酸化ストレス応答性多機能蛋白質2-Cysペルオキシレドキシン（Prx）であるHBP23（ヒトPAGホモログ）の結晶構造を決定し，2量体間で保存Ｓれたシステイン残基の架橋による酸化還元機構を三次元構造より明らかにするとともに，ヘムの結合部位などを推定した。
Hirotsu S. et al., and Hakoshima T.
Crystal structure of a multifunctional 2-Cys peroxiredoxin heme-binding protein 23 kDa/proliferation-associated gene product.
Proc Natl Acad Sci U S A. 1999 Oct 26;96(22):12333-8.
[ Journal / PubMed / PDB ]
ラット由来酸化ストレス応答性多機能蛋白質2-Cysペルオキシレドキシン（Prx）であるHBP23（ヒトPAGホモログ）の結晶構造を決定し，2量体間で保存Ｓれたシステイン残基の架橋による酸化還元機構を三次元構造より明らかにするとともに，ヘムの結合部位などを推定した。
Hirotsu S. et al., and Hakoshima T.
Crystal structure of a multifunctional 2-Cys peroxiredoxin heme-binding protein 23 kDa/proliferation-associated gene product.
Proc Natl Acad Sci U S A. 1999 Oct 26;96(22):12333-8.
[ Journal / PubMed / PDB ]
脳内プロテアーゼニューロプシンの結晶構造
海馬特異的セリンプロテアーゼでり，学習あるいは，てんかんなどの脳疾患との関連性が考えられているニューロプシン（Neuropsin）の結晶構造を決定し，このプロテアーゼがトリプシン族とカレキュレイン族のキメラ的特徴を備えていることを示し，基質特異性を三次元構造から考察した。
Kishi T. et al., and Hakoshima T.
Crystal structure of neuropsin, a hippocampal protease involved in kindling epileptogenesis.
J Biol Chem. 1999 Feb 12;274(7):4220-4.
[ Journal / PubMed / PDB ]
海馬特異的セリンプロテアーゼでり，学習あるいは，てんかんなどの脳疾患との関連性が考えられているニューロプシン（Neuropsin）の結晶構造を決定し，このプロテアーゼがトリプシン族とカレキュレイン族のキメラ的特徴を備えていることを示し，基質特異性を三次元構造から考察した。
Kishi T. et al., and Hakoshima T.
Crystal structure of neuropsin, a hippocampal protease involved in kindling epileptogenesis.
J Biol Chem. 1999 Feb 12;274(7):4220-4.
[ Journal / PubMed / PDB ]
1998
活性型低分子量Gタンパク質RhoAの結晶構造
ヒト由来低分子量G蛋白質RhoAのGTPγS結合型（活性型）結晶構造を決定し，Rhoファミリーに特徴的な１３残基の挿入部位はスイッチ機構に関与していないことを示すとともに，GTP-GDP交換によるRhoAのスイッチ機構を解明した。
Ihara K. et al., and Hakoshima T.
Crystal structure of human RhoA in a dominantly active form complexed with a GTP analogue.
J Biol Chem. 1998 Apr 17;273(16):9656-66.
[ Journal / PubMed / PDB ]
1997
ヒスチジンキナーゼArcBのHPtドメインの結晶構造
大腸菌の環境センサー蛋白質ArcBのC末端のリン酸基転移領域の結晶構造を決定し，この領域が細胞内情報伝達のHis-Aspリン酸基リレー機構において鍵となるモジュールであることを示した。４本鎖のα-ヘリックスの束から成るこの構造を，HPt（Histidine-containing Phospho-transfer）ドメインと名付けた。
Kato M. et al., and Hakoshima T.
Insights into multistep phosphorelay from the crystal structure of the C-terminal HPt domain of ArcB.
Cell. 1997 Mar 7;88(5):717-23.
[ Journal / PubMed / PDB ]
大腸菌の環境センサー蛋白質ArcBのC末端のリン酸基転移領域の結晶構造を決定し，この領域が細胞内情報伝達のHis-Aspリン酸基リレー機構において鍵となるモジュールであることを示した。４本鎖のα-ヘリックスの束から成るこの構造を，HPt（Histidine-containing Phospho-transfer）ドメインと名付けた。
Kato M. et al., and Hakoshima T.
Insights into multistep phosphorelay from the crystal structure of the C-terminal HPt domain of ArcB.
Cell. 1997 Mar 7;88(5):717-23.
[ Journal / PubMed / PDB ]
転写因子PHO4とDNAとの複合体の結晶構造
酵母リン酸代謝系の転写因子PHO4のbHLHモチーフ領域と標的DNAとの複合体結晶構造を決定し，bHLH型転写因子の共通認識塩基配列（E-box: CACGTG）の認識機構を明らかにするとともに，E-boxに隣接した塩基対の認識を示し，この型の転写因子の特異性の起源を論じた。
Shimizu T. et al., and Hakoshima
Crystal structure of PHO4 bHLH domain-DNA complex: flanking base recognition.
EMBO J. 1997 Aug 1;16(15):4689-97.
[ Journal / PubMed / PDB ]
酵母リン酸代謝系の転写因子PHO4のbHLHモチーフ領域と標的DNAとの複合体結晶構造を決定し，bHLH型転写因子の共通認識塩基配列（E-box: CACGTG）の認識機構を明らかにするとともに，E-boxに隣接した塩基対の認識を示し，この型の転写因子の特異性の起源を論じた。
Shimizu T. et al., and Hakoshima
Crystal structure of PHO4 bHLH domain-DNA complex: flanking base recognition.
EMBO J. 1997 Aug 1;16(15):4689-97.
[ Journal / PubMed / PDB ]
