平成26年度ワークショップ
ImageJ+Rハンズオン実習2014
平成26年6月12日(木)奈良先端科学技術大学院大学 研修ホールにて平成26年度ワークショップ「ImageJ+Rハンズオン実習2014」を開催致します(主催:NAIST植物科学グローバルトップ教育推進プログラム) 。本ワークショップでは、受講者に各自ノートパソコンを持ち込んでいただき、画像解析、生物統計、ゲノム・トランスクリプトーム解析にすぐに役に立つ実践的な実習を行います。
皆様奮ってご参加下さい。
※本ワークショップにご参加頂く為には、事前登録が必要です(受付は終了しました)。
【重要なお知らせ】
※実習までに持込用ノートパソコンに、ImageJ、Rの各ソフトをインストールしておくようお願いします。お早めのご準備をお願い致します:
<ImageJについて>
ImageJとそのプラグイン、解析用データをインストール・ダウンロードするための紹介ページ
※コンピューターのスペックは特に特殊なものは必要ありません
<Rについて>
対応可能なOS、及び、各ソフトウェアのバージョン:
Windows (64 bit、4GB以上)、R 3.1.0
Mac OS X(10.6以降、4GB以上)、R 3.1.0
(2014.5.15)
Rを用いたハンズオン実習受講者の皆様
以下の項目に関して、実習までに、当日持参するPCに準備をお願いいたします。
インストールの際、想定外のことが起こる可能性がありますので、お早めにご準備ください。
1)以下より実習用データをダウンロードしてください:
◆入江講師用
◆門田講師用
2)インストール手順書をダウンロードしてください
◆Windows用
◆Mac用
3)インストール手順書に書いてありますように、実習で用いるRのバージョンはR ver. 3.1.0およびBioconductor ver. 2.14です。
上記インストール手順はかなり時間がかかるものです。
その一方で実習に必要な最低限のパッケージはBiostringsとTCCのみですので、保証はできませんが以下のコピペでも大丈夫だと思われます。
---- ここから ---
source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("Biostrings", dependencies=TRUE)
biocLite("TCC", dependencies=TRUE)
--- ここまで ---
不明な点などございましたら、お気軽にお問合せください。